Для поддержки форматов M4a/Flac/Ogg/Ape/Mpc нам понадобиться установить plugin, скачать его можно тут. После его установки и обновления библиотеки в WMP появяться все файлы новых форматов. Работать с ними можно точно так же как и со всеми другими форматами.
Вот страничка авторов плагина Softpointer.